El máximo órgano de decisión de Greenpeace España es el Consejo, que está constituido por 75 representantes de los socios y socias.
60 miembros, elegidos directamente por los socios/as en circunscripciones correspondientes a las Comunidades Autónomas, y 15 miembros más, elegidos por el Consejo saliente de entre los socios/as de Greenpeace España y que hayan sido propuestos por los propios consejeros/as.
Entre las funciones del Consejo, que se detallan en los Estatutos, destacamos la aprobación de los presupuestos y del balance de actividades, que se debaten en la Asamblea Ordinaria que se celebra cada año en el mes de marzo. También elige entre sus miembros a las personas que integran la Junta Directiva, ejerciendo la supervisión y control de su trabajo. Es igualmente el órgano responsable de aprobar —y modificar cuando sea necesario— los Estatutos y el Reglamento de Funcionamiento Interno. Además de la Asamblea Ordinaria, el Consejo mantiene todos los años un encuentro en el mes de octubre.
Para facilitar el funcionamiento del Consejo, existen tres comisiones de carácter permanente (Comisión de Arbitraje, Comisión Electoral y Comisión de Funcionamiento Interno), así como grupos de trabajo de carácter temporal que se constituyen para abordar cuestiones concretas.
La permanencia en el Consejo es de periodos de tres años, repetibles de forma indefinida.
Finalizadas las elecciones que llevamos a cabo en 2019, el nuevo mandato comenzó el 28 de enero de 2020. Por primera vez, la presencia de mujeres ha dejado de ser minoritaria, y el nuevo Consejo está constituido ahora por 38 socias y 34 socios:
Alicia Escudero Escudier
Amelia Quílez Cerdà
Ana María Escrihuela Escrihuela
Ángeles Fernández Fuentes
Antonio Fernández Montoya
Benito Sánchez Lara
Carles García Domingo
Carmen Dominguez Penelas
Carmen Merino Hernández
Carmen Rodríguez Fernández-Blanco
Concepción Ruíz Fernández
Desiree Knoppen
Edita Olaizola
Elisenda Villena Barjau
Elizabeth Triado
Enrique Garzo Cano
Ernest Escude Mas
Ester Jordá Solbes
Francesç Simó Espert
Francisco González Barahona
Gema Bueno Morales
Germán Lozano García
Gloria Angulo Pineda
Gloria Cantos Rubert
Heike Schirmer
Idoia Olabarrieta Paul
Ignacio Ojeda Pérez
Ignacio Urrosolo Urkizu
Jan Kraft
Joaquín Arce Fernández
José Martinez Sanchez
José Luís Fernández Solís
Josefina Zamora Barceló
Juan Lobato Valero
Juan Carlos Urbón Castillejos
Juan Manuel Rubio Arcones
Julio Calzada Rodríguez
J. David Sandoval Salvador
Luigi Ceccaroni
Lupe Pozo Gimon
María Dolores Del Olmo García
María Dolores Muñoz Aznar
Mª José Gomez Donat
Maitane Najarro García
Manuel Justel Sánchez
María Villanueva Vico
Marta López Beriso
Miguel López Cabanas
Miguel Pérez-Lozao Gallego
Mónica Fernández Lorenzo
Naiara Dobaran Santiago
Óscar Alonso Asensio
Pablo Óscar González Prieto
Paloma Pastor Alfonso
Pedro José Domínguez López
Pilar Boix Samperfecto
Pilar Fernández Palmer
Raquel Prieto Malillos
Raquel Hernández Adrián
Ricard Duró Lago
Sandra Ayuso Sánchez
Serafín Valencia Triviño
Sonia Rubio Hernando
Teresa Villar Arnal
Teresa García Álvarez
Víctor Barahona Ormazabal
Víctor Viñuales Edo
Víctor Daniel López Lorente
Víctor José Cuevas Barbadillo
Xavier Xortó Borràs
Xosè Peña Fernández